到20世紀30年代，由于在湖區(qū)地下發(fā)現(xiàn)有湖相、海相沉積物等，所以學術界對太湖的形成有了較成熟和系統(tǒng)的看法。著名的地理學家竺可楨與汪湖楨等提出了湖成因論，湖論在以后又不斷被充實進新的內(nèi)容。德國人費師孟在1941年提出，經(jīng)太倉、嘉定外岡、上海縣馬橋、金山漕涇，直至杭州灣中的王盤山附近，是公元1?3世紀的海岸線。后經(jīng)對位于岡身的馬橋文化遺址下的貝殼碎屑進行碳-14測定，研究者基本上公認岡身是6000年前的古海岸線。

華東師范大學海口地理研究所的陳吉余教授等，在總結前人研究的基礎上，發(fā)展和完善了湖論。該論點主要依據(jù)太湖平原存在著海相沉積來推斷，認為因長江帶來的大量泥沙逐漸在下游堆積，使當時的長江三角洲不斷向大海伸展，從而形成了沙嘴。

以后沙嘴又逐漸環(huán)繞著古太湖的東北岸延伸并轉(zhuǎn)向東南，與錢塘江北岸的沙嘴相接，將古太湖圍成一個湖。后來又因為泥沙的不斷淤積，這個瀉湖逐漸成為與海洋完全隔離的大小湖泊，太湖則是這些分散雜陳的湖群的主體，又經(jīng)以后的不斷淡化而成為今日的太湖。

近年來，隨著對太湖地區(qū)地質(zhì)、地貌、水文、考古和文獻資料等方面的不斷研究，尤其是幾十處距今5000?6000年前的新石器時代遺址，以至漢、唐、宋文化遺物的發(fā)現(xiàn)，許多研究者對湖論中所存的問題提出了質(zhì)疑。他們認為，在海水深入古陸地的過程中，雖然是一邊沖蝕，一邊沉積，但這種情況對于整個古陸地來說是不平衡的，有的地方雖有湖地貌的沉積，但它不具整體意義。