最新的一種解說認(rèn)為它是建文帝的“伐燕檄詔”，隱藏著一段歷史謎案。研究者認(rèn)為明初“靖難之役”后，建文帝在親信隨從的保護(hù)下，隱匿到了貴州的山谷之間。躲避數(shù)月后，他很想號召臣民支持他東山再起，推翻朱棣，但苦于自己身單力孤，加上朱棣的爪牙眾多，難于應(yīng)付，便想出了這么一個討伐朱棣的檄文，讓隨從以金文的變體加上篆體、隸書、象形文字、草書以及圖畫的形義綜合成一種“雜體”，然后用皇帝詔書的形式刻寫于紅崖之上。

根據(jù)這一大膽的假想，研究者進(jìn)而“破譯”出“天書”的內(nèi)容為：“燕反之心，迫朕（皇龍）遜國。叛逆殘忍，金川門破。殘酷殺害（段、毆、牢、殺子民），致尸橫、死亡、白骨累累，罄竹難書。使大明日月無光，變成囚殺地獄。須降伏燕魔做階下囚（斬首消滅）。丙戌（年）甲天下之鳳皇——允（御制）。”

對此，專家提出了不同的看法。他們指出，關(guān)于建文帝的下落現(xiàn)在仍是一樁謎案，歷史學(xué)界長期流行著兩種主要說法：一是建文帝在宮中自焚而死，一是建文帝流落海外。至于他是否逃到了貴州，僅靠“紅崖天書”來斷定證據(jù)是不足的，至多只能是一種個人猜測，在史學(xué)上價值不大。

還有人認(rèn)為，“紅崖天書”產(chǎn)生于新石器時代，是比殷代甲骨文更原始的圖畫會意文字，或稱古圖形文字。它有形可象，有意可會，其造字的原理和釋讀方法，與甲骨文一樣。不過后者是前者圖形的線條化，在表現(xiàn)方法上前者更原始，可說是古文字的雛形和活化石。通過辨別“天書”上每個圖形所表現(xiàn)的物體，他們認(rèn)為其應(yīng)該是一則古時的“公告”。由此，還可以將中國有文字的歷史從距今3200年的殷代甲骨文提前至新石器時代。