北京城里的故宮有房9999間半，潭柘寺在鼎盛時(shí)期的清代有房999間半，儼然是故宮的縮影。另外，寺內(nèi)還建有只有在中南海、圓明園、恭王府才見得到的流杯亭，而毗盧閣頂上大脊兩端的吻獸上的“鳳在上，龍?jiān)谙隆钡膱D案則更是罕見，除了清東陵的慈禧墓外，這里是絕無(wú)僅有的一處了。寺內(nèi)的延清閣和旃檀佛樓巧妙地利用了寺內(nèi)地勢(shì)的高低不同，從南看是兩層樓閣，從北看是一層的軒堂，與頤和園內(nèi)諧趣園的矚新樓建筑風(fēng)格相同。潭柘寺建于故宮之前，因此，故宮的建設(shè)者從潭柘寺的布局模式中得到啟發(fā)，找到靈感，應(yīng)該是有道理的。

但也有人提出不同看法，他們認(rèn)為，潭柘寺的建筑規(guī)格雖然很高，但紫禁城并不是仿它而建。

持這種觀點(diǎn)的理由是，潭柘寺在明清期間就已經(jīng)是皇家寺院了，在其不斷的維修和擴(kuò)建過(guò)程中，會(huì)有大量的皇家建筑風(fēng)格融入其中。潭柘寺的大雄寶殿是重檐廡殿頂，與故宮太和殿的設(shè)計(jì)模式如出一轍，其殿脊琉璃鴟吻被四條鎏金長(zhǎng)鏈“鎖住”的造型也與太和殿的鴟吻一樣。金黃色的琉璃瓦、斗拱和彩畫、璽金龍彩畫等，這些都體現(xiàn)了潭柘寺在明清時(shí)期的皇家地位。

寺內(nèi)擁有楞嚴(yán)壇、朝房、大悲壇、毗盧閣、觀音殿、流杯亭、行宮院等大量類似皇家園林的建筑，只是說(shuō)明清朝歷代皇帝將潭柘寺當(dāng)作了自己的家廟，因此融合了大量皇家氣氛。但到底是故宮仿照潭柘寺，還是潭柘寺效法故宮，仁者見仁，智者見智，眾說(shuō)紛紜，到現(xiàn)在還是沒有定論。