自從被人類發(fā)現(xiàn)后，敦煌學也隨之興起，學者們紛紛探討藏經(jīng)洞封閉之謎。它是何時被封閉的？為什么要封閉呢？種種猜測不絕于耳。

1．一些研究者認為，莫高窟的僧人為躲避戰(zhàn)亂，使經(jīng)卷遺書免于戰(zhàn)火而存放的。但究竟是在什么情況下封閉的呢？學者們各執(zhí)己見。其中最有代表性的說法是，宋初西夏人占領(lǐng)敦煌之前，千佛洞的僧人為躲避戰(zhàn)亂，臨走前便把經(jīng)卷、佛像、文書等藏入洞內(nèi)封閉。

2．另一部分學者認為，這些經(jīng)卷都是當時敦煌僧眾拋棄無用的廢品。因為當時佛經(jīng)太多，人們又尊重佛法，這些廢棄的經(jīng)品既不能丟掉，也不能燒毀，只好用石室將其全部封存起來。

3．還有人認為敦煌藏經(jīng)洞的封閉是為了改造書庫。總之各家說法不一。

莫高窟藏經(jīng)洞重見天日的時候，正值清王朝走向末日之時，從政府到地方官員根本沒有投入精力和財力來保護這些國寶。

更為可悲的是敦煌藏經(jīng)洞的發(fā)現(xiàn)者王道士又是一個貪圖錢財，缺乏民族責任感的人，就使藏經(jīng)洞的命運更是悲上加悲。

敦煌藏經(jīng)洞中共出土文物5萬余件，目前國內(nèi)所藏藏經(jīng)洞的文書僅有9000多件，大量的珍貴文物不知何時才能回歸家園。