然而施今墨父施小航認(rèn)為通過讀書踏入仕途才是正道。于是1902年就送施今墨進(jìn)山西大學(xué)堂（今山西大學(xué)）讀大學(xué)。在這所近代新型大學(xué)，他不斷受到進(jìn)步思潮的影響，逐步產(chǎn)生了民主與革命的思想。后不滿并反對學(xué)堂西齋主持人、英人李提摩太的專制，受到了校方處理，才不得以中途轉(zhuǎn)讀山西法政學(xué)堂。

不久又以優(yōu)異成績被保送京師法政學(xué)堂。在這里，他結(jié)識了黃興，由其介紹加入了同盟會，從此開始了革命生涯。以后，施今墨使以醫(yī)療為掩護(hù)，隨黃興奔走革命。1911年辛亥革命推翻了清封建王朝，施今墨曾作為山西代表，在南京參加了孫中山就任大總統(tǒng)典禮。

以后一度在陸軍部協(xié)助黃興（任陸軍總長）工作，主要協(xié)助其制定陸軍法典。在《陸軍刑法》?！蛾戃姂土P令》人陸軍審判章程》的原稿中都留有他的手筆。袁世凱篡權(quán)后，孫中山出走，黃興病故，施今墨應(yīng)湖南督軍譚延閣之聘，出任了湖南省教育廳長。

不久又應(yīng)直隸水利督辦熊希齡的邀請，出任北京香山慈幼院副院長，志在此創(chuàng)造一個(gè)充滿自由、平等、博愛的理想境地，但因社會腐敗，壯志難酬，憤而辭職，決心棄政從醫(yī)。

由此1921年，遂改名為“今墨”。取義一紀(jì)念誕生地“黔”；二學(xué)習(xí)墨子，行兼愛之道，治病不論貴賤，施愛不分貧富；三醫(yī)術(shù)上勇于草新，要成為當(dāng)代繩墨（分之墨準(zhǔn)之意）。

這時(shí)，施今墨經(jīng)多年診療實(shí)踐，且本人一直刻苦研習(xí)，醫(yī)術(shù)已有相當(dāng)水平，在京師名聲大噪，深得民眾贊譽(yù)。1925年孫中山在京臥病，施今墨曾應(yīng)邀參加會診。