施今墨又是進(jìn)行中醫(yī)革新和中西醫(yī)結(jié)合的先驅(qū)。早在20年代，就開始應(yīng)用西醫(yī)病名。曾提出“中醫(yī)現(xiàn)代化，中藥工藥化”的口號(hào)。他認(rèn)為，醫(yī)學(xué)是和死亡作斗爭(zhēng)的科學(xué)，應(yīng)該與時(shí)俱進(jìn)，精益求精。

他主張中醫(yī)與西醫(yī)并存，最早提倡互相結(jié)合，取長(zhǎng)補(bǔ)短。提出“學(xué)術(shù)無(wú)國(guó)界而各有增長(zhǎng)?！薄霸\斷以西法為精密，處方以中藥為完善?！薄盁o(wú)論中醫(yī)西醫(yī)，其理論正確，治療有效者，皆信任之；反之，摒棄不可用也。”

施今墨還十分重視和關(guān)心中醫(yī)人才的培養(yǎng)和中醫(yī)學(xué)術(shù)思想的傳播，為我國(guó)中醫(yī)事業(yè)的長(zhǎng)足發(fā)展做出了重要貢獻(xiàn)。1932年他在北京創(chuàng)辦了華北國(guó)醫(yī)學(xué)院，講授中西醫(yī)課程，是中國(guó)近代史上第一所新型醫(yī)學(xué)院。還創(chuàng)辦過(guò)中醫(yī)學(xué)校、中醫(yī)講習(xí)所和中醫(yī)研究所等。

1954年，施今墨在受到周恩來(lái)總理的接見時(shí)，還提出建議，成立中醫(yī)科學(xué)研究院、中醫(yī)醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)學(xué)院。

在一次中醫(yī)中藥展覽會(huì)上，施今墨曾就出了治療胃潰瘍、十二指腸潰瘍、高血壓、神經(jīng)衰弱、肝硬化、肝脾腫大、氣管炎等病的十大驗(yàn)方。據(jù)此制成的“高血壓速降丸”、“神經(jīng)衰弱丸”、“感冒丸”、“氣管炎丸”等曾暢銷海內(nèi)外。

新中國(guó)成立后，施今墨曾任北京醫(yī)院中醫(yī)顧問(wèn)、中醫(yī)研究院顧問(wèn)、中華醫(yī)學(xué)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)等，被邀請(qǐng)擔(dān)任第二、三、四屆全國(guó)政協(xié)委員。十年“文革”動(dòng)亂中，施今墨也遭到了迫害。