2008年，從大報恩寺前身的長干寺地宮出土了震驚世界和佛教界的世界唯一一枚"佛頂真骨"、"感應(yīng)舍利"、"諸圣舍利"以及"七寶阿育王塔"等一大批世界級文物與圣物，是中國規(guī)格最高、規(guī)模最大、保存最完整的寺廟遺址。2011年，評為"2010年度全國十大考古新發(fā)現(xiàn)"。2025年，被國務(wù)院核定公布為全國重點文物保護(hù)單位。2025年底，大報恩寺遺址公園正式開放。

大報恩寺琉璃塔的歷史發(fā)展過程介紹：

大報恩寺是南京歷史最為悠久的佛教寺廟，千余年間，屢廢屢建，寺名亦屢屢更易，大報恩寺塔立于南朝寺廟發(fā)祥地和江南佛教中心。南朝四百八十寺，多少樓臺煙雨中"，杜牧這兩句詩中"四百八十寺"的起源就是大報恩寺，大報恩寺的歷史從孫吳開始，歷經(jīng)各朝，有過長干寺、天禧寺等名字，大報恩寺塔的前身則是阿育王塔。

東吳赤烏年間(238─250年)，孫權(quán)建建初寺及阿育王塔，為江南塔寺之始，有"江南第一寺"之稱，是繼洛陽白馬寺之后的中國第二座寺廟，也是中國南方地區(qū)的首座寺廟。經(jīng)過考證，阿育王塔約建于東漢獻(xiàn)帝的興平年間(194─195年)，是南京最古老的佛塔，也是中國最早的佛塔之一。建塔者極有可能是秣陵人符融，他曾任徐州刺史陶謙麾下之廣陵、下邳、彭城三郡的運漕官，并以漕運所得經(jīng)費建廟蓋塔。符融為最早見于正史的中國閣樓式佛塔的創(chuàng)始者，后退守故里秣陵，為孫策攻滅。

東吳赤烏十年(247年)東吳大帝孫權(quán)為康居國僧人會在長干里修建建初寺和阿育王塔，成為江南塔寺之始。