第二天，武宗親自出馬，去抄劉瑾的家。結(jié)果發(fā)現(xiàn)劉瑾家中有私刻的皇帝印璽，以及玉帶、龍袍、盔甲武器等禁止百姓和官員私自擁有的禁物，在劉瑾經(jīng)常拿著的扇子中還發(fā)現(xiàn)了兩把匕首。武宗見了大怒，終于相信劉瑾謀反的事實，立即下令將劉瑾凌遲處死。當(dāng)時有個叫張文麟的刑部主事，親見劉瑾被凌刑的過程，并將此事記錄下來。

根據(jù)規(guī)定，凌遲刀數(shù)應(yīng)該為3357刀，每10刀一歇一吆喝，行刑的第一、二兩日按規(guī)定先剮357刀，從胸膛左右起，剮肉如指甲片大小。初動刀則有血流寸許，再動刀則不見血了?？赡苁怯捎诜溉耸荏@，血流入小腹、小腿肚，刀剮完畢，開膛剖腹，則見血從這些地方流出。行刑當(dāng)晚押劉瑾到順天府宛平縣寄監(jiān)，松綁數(shù)刻，當(dāng)時劉瑾尚能食粥。第二天，繼續(xù)押至刑場。

劉瑾就刑時，亂言宮內(nèi)之事，劊子手以麻核桃塞其口，數(shù)十刀以后劉瑾暈死過去。行刑的那些天，京城沸騰，刑場周圍，人山人海。原來受過劉瑾迫害的人家紛紛用一文錢買下一片肉以祭冤死者，甚至將其肉生吞下去，以解心頭之恨。

劉瑾專權(quán)期間，到底搜刮了多少錢財至今還是個歷史之謎。抄沒的劉瑾家財數(shù)字，史書記載不一，其中據(jù)《明史紀(jì)事本未補(bǔ)編》所載是：“金二十四萬錠又五萬七千八百兩，元寶五百萬錠，銀八百萬又一百五十三萬三千六百兩，寶石二斗，金甲二千、金鈞三千，玉帶四千一百六十二束，獅蠻帶二束，金銀湯盥五百，蟒衣四百七十襲，牙牌二匱，穿宮牌五百，金牌三，兗龍袍四領(lǐng)，八爪金龍盔甲三十副，玉琴一，玉瑤印一。共金一千二百五十萬七千八百兩，銀共二萬五千九百五十萬三千六百兩?！辈谎远鳎瑒㈣侵袊鴼v史上最貪冒聚斂的大貪官之一。