公元前33年，呼韓邪再次到長安。漢元帝根據(jù)他的請求，把宮女王嬙（字昭君）嫁給他為妻，這就是歷史上有名的“昭君出塞”。王昭君的出塞和親，對鞏固漢匈兩族的友好關系，起到了積極的作用。

東漢初期，漢光武帝建武二十四年（公元48年），匈奴分裂為南北兩部。呼韓邪單于之孫日逐王比率領八部4500部眾投歸于漢。襲用他祖父的稱號，也稱呼韓邪單于。

漢朝幫助他在西河郡的美稷縣（今內(nèi)蒙古準格爾旗一帶）設立南單于庭。南匈奴入居塞內(nèi)，分布在今山西北部、陜西北部、內(nèi)蒙古呼和浩特至包頭一帶，因和漢人雜居，吸收漢人的文化，南匈奴迅速興旺起來。

漢和帝永元元年（公元89年），漢朝與南單于聯(lián)軍大破北匈奴與稽落山（漠北西北部的額布根山），公元91年，大破北匈奴與金薇山（今阿爾泰山），北單于率領部眾向西走到今伊犁河上游一帶，后轉(zhuǎn)徙康居（在今中亞）。

這部分匈奴人的后裔后經(jīng)中亞細亞，至公元4世紀到達東歐。4世紀后期，匈奴人戰(zhàn)勝阿蘭人、東歌德人等；又擊敗東羅馬帝國，侵入中歐，以班諾尼亞為中心，進行活動。

阿提拉統(tǒng)治時，其疆域大致東起里海，西至波羅的海和萊茵河，建立起強大的匈奴帝國。公元451年沙隆之戰(zhàn)失敗。453年阿拉提逝世，匈奴帝國迅速瓦解。

公元140年，南匈奴發(fā)生內(nèi)訌，匈奴奴隸制政權(quán)崩潰，分裂為五部。