侯學煜的主要著作有：

侯學煜，中國境內(nèi)酸性土鈣質(zhì)土和鹽堿土的指示植物，中國科學院，1952年

侯學煜，中國境內(nèi)酸性土鈣質(zhì)土和鹽堿土的指示植物，科學出版社，1954年

侯學煜，植物生態(tài)地理學的內(nèi)容任務概念和研究方法，科學出版社，1956年

侯學煜，貴州省及其鄰近地區(qū)的蕨類植物生態(tài)環(huán)境的初步觀察（植物生態(tài)學與地植物學資料叢刊第14號），科學出版社，1957年

侯學煜、林厚萱、章彗麟，中國150種植物的化學成分及其分析方法，高等教育出版社，1959年

侯學煜 編著，中國的植被，人民教育出版社，1960年

侯學煜，中國植被地理及優(yōu)勢植物化學成分，科學出版社，1982年

侯學煜 供稿編寫，初級中學課本植物學教學掛圖——我國的植物群落，上海教育出版社，1983年

侯學煜，中國自然生態(tài)區(qū)劃與大農(nóng)業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略，科學出版社，1988年

侯學煜，中國自然地理 植物地理（下冊）（中國植被地理），科學出版社，1988年

植被生態(tài)學研究編輯委員會，植被生態(tài)學研究——紀念著名生態(tài)學家侯學煜教授，科學出版社，1994年

侯學煜，1:1 000 000 中國植被圖集，中國地圖出版社，2001年