1935年，學校開辦研究生教育。

1936年，學校成立農學院，從而發(fā)展成為有文、法、理、工、農5個學院15個系2個研究所的綜合大學。

1937年，國立武漢大學與國立中央大學（1949年更名南京大學）、國立清華大學、國立北京大學和國立浙江大學統(tǒng)一進行招生考試，從而躋身“民國五大名?！薄?/p>

1938年，因武漢會戰(zhàn)爆發(fā)，國立武漢大學被迫西遷四川樂山繼續(xù)辦學，農學院并入國立中央大學。

武漢淪陷后，日軍將武大校園辟為其中原司令部。

1945年8月15日，日本宣布無條件投降。同年9月1日，國立武漢大學成立復校委員會。

1946年，武漢大學恢復農學院，設立醫(yī)學院，并遷回武昌珞珈山，設有文、法、理、工、農、醫(yī)6個學院21個系8個研究所。

1947年，學校設立醫(yī)學院及其附屬醫(yī)院，形成了文、法、理、工、農、醫(yī)6大學院21個系8個研究所。 

建國之后

1949年武漢解放時，國立武漢大學被中國共產黨接管并更名為武漢大學，繼續(xù)辦學。

1950年，湖南大學水利系劃歸武漢大學，與土木系水利組合并，成立水利系；武漢大學醫(yī)學院從武漢大學分出，與上海同濟大學醫(yī)學院合并成中南同濟醫(yī)學院（今華中科技大學同濟醫(yī)學院）。