《拉薩條約》本身，盡管被英國(guó)人誘騙在上面蓋了西藏地方政府官員的章，但一直沒(méi)有得到清政府的認(rèn)可，再者，西藏地方政府不能代表清政府簽約，它也沒(méi)有單獨(dú)和外國(guó)簽訂任何條約的權(quán)利。所以，這個(gè)條約從根本上是非法的、無(wú)效的。

清朝外務(wù)部在接到《拉薩條約》后，認(rèn)為這個(gè)條約有損主權(quán)，須另行議定。于是立即電告有泰，不準(zhǔn)簽約。后來(lái)，也就是1904年12月，清朝派唐紹儀、張蔭棠在印度加爾各達(dá)與英國(guó)人重開談判，將《拉薩條約》中有損中國(guó)主權(quán)的條款去掉了，達(dá)到了挽回中國(guó)對(duì)西藏?fù)碛械闹鳈?quán)?！独_條約》就此告一段落。